¿Dónde puedo encontrar el número de serie?

Puedes encontrar el número de serie en el cuadro de diálogo "Acerca de...", seleccionando "Ayuda/Acerca de..." en el menú principal del programa LanDTM, (ventana gráfica).

¿Existe alguna incompatibilidad si quiero trabajar con este programa y tengo Protopo?

Podrías hacerlo perfectamente, no existe incompatibilidad. De todas formas, todo lo que hay dentro de este programa ya está integrado en Protopo. Así que si tienes Protopo no necesitas este programa.